Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LSAMPQ13449 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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