Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USP4Q13107 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USP4Q13107 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USP4Q13107 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USP4Q13107 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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USP4Q13107 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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USP4Q13107 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USP4Q13107 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USP4Q13107 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USP4Q13107 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USP4Q13107 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USP4Q13107 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USP4Q13107 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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USP4Q13107 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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USP4Q13107 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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USP4Q13107 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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USP4Q13107 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
USP4Q13107 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
USP4Q13107 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
USP4Q13107 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
USP4Q13107 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
USP4Q13107 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
USP4Q13107 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
USP4Q13107 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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USP4Q13107 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
USP4Q13107 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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