Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXF2Q12947 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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FOXF2Q12947 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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FOXF2Q12947 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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