Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIAQ12857 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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