Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCAPQ12770 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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