Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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