Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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HOXA3O43365 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HOXA3O43365 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HOXA3O43365 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HOXA3O43365 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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