Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
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