Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TRERF1Q96PN7 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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TRERF1Q96PN7 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TRERF1Q96PN7 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRERF1Q96PN7 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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