Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TPRNQ4KMQ1 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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