Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP2B3Q16720 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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