Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SNCBQ16143 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SNCBQ16143 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SNCBQ16143 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SNCBQ16143 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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SNCBQ16143 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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SNCBQ16143 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SNCBQ16143 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SNCBQ16143 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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