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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
MIR5190-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MIR3941-201
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103 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RSL24D1P11-201
ENST00000591045
491 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
BNIP3P39-201
ENST00000601077
554 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AL021368.1-201
ENST00000607490
540 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
uc_338.34-201
ENST00000617467
174 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SCARNA4-201
ENST00000629045
128 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC005592.1-201
ENST00000566527
1640 nt
BASIC
-0.18
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
LRRD1-203
ENST00000430130
2661 nt
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TSL 5
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
Y_RNA.36-201
ENST00000362602
112 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORD114-5-201
ENST00000362928
70 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNY1P12-201
ENST00000364251
105 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
Y_RNA.367-201
ENST00000365544
101 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-1286P-201
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107 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNA5SP494-201
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129 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORD83.1-201
ENST00000411362
77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC090572.1-201
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160 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
LINC02442-201
ENST00000537732
343 nt
TSL 3
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC006435.5-201
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112 nt
BASIC
-0.19
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
Y_RNA.18-201
ENST00000362461
102 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-137P-201
ENST00000363680
108 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-654P-201
ENST00000364373
107 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MIR320B2-201
ENST00000408479
138 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MIR548H2-201
ENST00000408874
88 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MRPS10P2-201
ENST00000431226
381 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AL392103.1-201
ENST00000447000
198 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MRPS10P1-201
ENST00000448483
130 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RPS3AP17-201
ENST00000472594
777 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC016550.1-201
ENST00000505348
785 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU7-41P-201
ENST00000515917
61 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORA25.12-201
ENST00000516202
82 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC069113.1-201
ENST00000517763
267 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC099520.1-206
ENST00000523434
486 nt
TSL 3
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AHI1-212
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441 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
PARPBP-209
ENST00000537257
976 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC023796.2-201
ENST00000545410
451 nt
TSL 3
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MIR4300-201
ENST00000581016
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MIR4775-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MIR4438-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORA25.18-201
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BASIC
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SNCB
Q16143
AL139418.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC009878.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AL008636.1-201
ENST00000625038
1018 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-227P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
Y_RNA.100-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
Y_RNA.118-201
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101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNA5SP48-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-660P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORA20.2-201
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BASIC
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SNCB
Q16143
MIR891A-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORD71-201
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86 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC105271.1-202
ENST00000411417
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TSL 3
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
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311 nt
TSL 2
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
ANKRD10-IT1-201
ENST00000426991
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AL365258.1-201
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TSL 3
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC092436.3-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
Y_RNA.672-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU2-56P-201
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BASIC
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SNCB
Q16143
RNU6-341P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
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ENST00000527345
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
NDUFAF4P1-201
ENST00000559425
519 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AGGF1P4-201
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801 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MIR3612-201
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC091178.2-201
ENST00000584401
117 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORD11B-201
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90 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC099654.13-201
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-1266P-201
ENST00000362794
105 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-756P-201
ENST00000383997
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-1127P-201
ENST00000384580
107 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
EIF4E2P1-201
ENST00000393781
255 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC069542.1-201
ENST00000445235
557 nt
TSL 3
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
EPS15P1-201
ENST00000448836
336 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
HSFY5P-201
ENST00000453726
309 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC073359.2-201
ENST00000478814
351 nt
TSL 3
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
Y_RNA.673-201
ENST00000516306
88 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
SNORD27.1-201
ENST00000516319
72 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-612P-201
ENST00000516909
102 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RNU6-58P-201
ENST00000517143
103 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
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ENST00000531656
154 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC112693.2-201
ENST00000556538
232 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
AC005730.3-201
ENST00000583067
366 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
RBM11P1-201
ENST00000604951
799 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
uc_338.11-201
ENST00000619132
160 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SNCB
Q16143
MTND4P4-201
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1366 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
RNU6-1097P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
RNU4-41P-201
ENST00000364426
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
Y_RNA.399-201
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105 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
MIR454-201
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115 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
SNORD70.1-201
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
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ENST00000410319
137 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
AL512656.1-201
ENST00000427492
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
UPP2-IT1-201
ENST00000439185
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
RNU7-182P-201
ENST00000459009
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
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437 nt
TSL 3
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SNCB
Q16143
HIF1AP1-201
ENST00000553642
175 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
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Q16143
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BASIC
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SNCB
Q16143
AC027279.3-201
ENST00000625055
122 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
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