Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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USF2Q15853 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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USF2Q15853 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
USF2Q15853 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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USF2Q15853 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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USF2Q15853 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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USF2Q15853 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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USF2Q15853 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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USF2Q15853 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
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USF2Q15853 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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