Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NEDD8Q15843 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NEDD8Q15843 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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