Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SHPRHQ149N8 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
SHPRHQ149N8 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
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