Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SMCO1Q147U7 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
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