Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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GBX1Q14549 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GBX1Q14549 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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