Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NEDD9Q14511 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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