Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
FOXE3Q13461 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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FOXE3Q13461 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXE3Q13461 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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