Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
IKZF1Q13422 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IKZF1Q13422 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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