Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PTPRCP08575 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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