Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
TDP1Q9NUW8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TDP1Q9NUW8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TDP1Q9NUW8 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TDP1Q9NUW8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TDP1Q9NUW8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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