Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRIM4Q9C037 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TRIM4Q9C037 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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TRIM4Q9C037 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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TRIM4Q9C037 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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TRIM4Q9C037 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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TRIM4Q9C037 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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TRIM4Q9C037 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM4Q9C037 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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