Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
FOXQ1Q9C009 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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FOXQ1Q9C009 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
FOXQ1Q9C009 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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