| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008852.1-201 | ENST00000510198 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-911P-201 | ENST00000516523 | 104 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYCSP23-201 | ENST00000519781 | 313 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL442163.3-201 | ENST00000554110 | 156 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL157911.1-202 | ENST00000554123 | 502 nt | TSL 3 BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007485.1-201 | ENST00000616755 | 206 nt | BASIC | 2.26 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | VPS54-202 | ENST00000354504 | 3594 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | XRCC4-202 | ENST00000338635 | 1579 nt | APPRIS P4 TSL 2 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.31-201 | ENST00000362574 | 102 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-474P-201 | ENST00000384243 | 107 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR597-201 | ENST00000384968 | 97 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR548B-201 | ENST00000385247 | 97 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD12B-201 | ENST00000410433 | 91 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092813.2-201 | ENST00000434540 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PCNPP5-201 | ENST00000452246 | 481 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01766-201 | ENST00000453968 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU1-131P-201 | ENST00000458943 | 161 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.631-201 | ENST00000459607 | 101 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC067942.3-201 | ENST00000512025 | 362 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-34P-201 | ENST00000516534 | 121 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4-77P-201 | ENST00000516692 | 156 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AK6P2-201 | ENST00000549020 | 471 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL357054.2-201 | ENST00000607644 | 423 nt | TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL357075.2-201 | ENST00000614906 | 189 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HS1BP3-208 | ENST00000631166 | 78 nt | TSL 5 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL606534.2-204 | ENST00000635008 | 178 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KPNA5-202 | ENST00000368564 | 11311 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MRPL42-202 | ENST00000393128 | 1983 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR5M1-202 | ENST00000641076 | 4302 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MUC15-202 | ENST00000436318 | 3118 nt | TSL 5 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | XRCC4-205 | ENST00000511817 | 1636 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC245060.5-201 | ENST00000610778 | 3293 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092881.1-201 | ENST00000638218 | 2733 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.80-201 | ENST00000362996 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.128-201 | ENST00000363391 | 112 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | U3.8-201 | ENST00000363675 | 217 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.485-201 | ENST00000384395 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1235P-201 | ENST00000384559 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR1283-2-201 | ENST00000408621 | 87 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP450-201 | ENST00000411206 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-57P-201 | ENST00000411348 | 103 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-498P-201 | ENST00000459468 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.701-201 | ENST00000516812 | 110 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SKP295-201 | ENST00000517264 | 153 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C18orf54-203 | ENST00000578138 | 776 nt | TSL 3 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC083806.3-201 | ENST00000614016 | 455 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL138825.1-201 | ENST00000618587 | 192 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | snoZ196.1-201 | ENST00000625269 | 89 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC134503.1-201 | ENST00000633048 | 54 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL159152.1-201 | ENST00000635019 | 2587 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SAGE1-201 | ENST00000324447 | 2952 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ANKRD20A9P-201 | ENST00000457997 | 2978 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA16B-201 | ENST00000364674 | 135 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-926P-201 | ENST00000384075 | 107 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-708P-201 | ENST00000384217 | 107 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNY3P4-201 | ENST00000384428 | 101 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNAP23-203 | ENST00000397138 | 477 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTCO3P19-201 | ENST00000415864 | 321 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MCFD2P1-201 | ENST00000417812 | 300 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL160004.2-201 | ENST00000432935 | 350 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND2P29-201 | ENST00000438595 | 412 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007677.1-201 | ENST00000445757 | 515 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NDUFB4P10-201 | ENST00000452541 | 359 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA40.9-201 | ENST00000515895 | 93 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC121758.2-201 | ENST00000553271 | 193 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HSBP1P1-201 | ENST00000555205 | 166 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3169-201 | ENST00000578032 | 83 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01919-202 | ENST00000579506 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR5188-201 | ENST00000583467 | 113 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD58B-201 | ENST00000607313 | 66 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNFX1-AS1_2.1-201 | ENST00000610973 | 93 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RBMS2-209 | ENST00000639027 | 192 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF334-205 | ENST00000615481 | 3706 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC130466.1-201 | ENST00000636354 | 4683 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NEDD4-205 | ENST00000506154 | 6751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SCN7A-201 | ENST00000409855 | 7183 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR144-201 | ENST00000384886 | 86 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PMCHL1-202 | ENST00000423102 | 261 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL445646.1-201 | ENST00000431784 | 216 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-856P-201 | ENST00000516959 | 98 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC023442.1-201 | ENST00000531247 | 422 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4524B-201 | ENST00000581569 | 115 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC245748.3-201 | ENST00000588710 | 241 nt | TSL 3 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | hsa-mir-548d-1.1-201 | ENST00000636914 | 97 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR2L2-202 | ENST00000641771 | 4300 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009487.4-201 | ENST00000624969 | 3585 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HAS2-201 | ENST00000303924 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CCDC30-201 | ENST00000340612 | 2664 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SLCO1B3-202 | ENST00000381545 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYLC2-204 | ENST00000612124 | 1817 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.05 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIRLET7G-201 | ENST00000362280 | 84 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP432-201 | ENST00000362480 | 116 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.27-201 | ENST00000362540 | 103 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.498-201 | ENST00000384460 | 102 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR17-201 | ENST00000385012 | 84 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL512604.1-201 | ENST00000404812 | 257 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR548P-201 | ENST00000408336 | 84 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |