Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TPRNQ4KMQ1 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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