Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF239Q16600 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF239Q16600 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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