Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNGA3Q16281 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNGA3Q16281 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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