Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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UBE3CQ15386 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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UBE3CQ15386 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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UBE3CQ15386 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
UBE3CQ15386 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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