Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SLC10A1Q14973 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SLC10A1Q14973 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms