Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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