Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SCARF1Q14162 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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