Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PKD2Q13563 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PKD2Q13563 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 437.1 ms