Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
DUSP4Q13115 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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