Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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