Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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CHD3Q12873 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD3Q12873 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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