Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
HOXD10P28358 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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