Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTIFO43310 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CTIFO43310 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTIFO43310 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTIFO43310 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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