Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms