Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNIKQ9UKE5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms