Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NKX1-2Q9UD57 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms