Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms