Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRDE2Q9H7Z3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms