Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MIXL1Q9H2W2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms