Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Efhd1Q9D4J1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Efhd1Q9D4J1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Efhd1Q9D4J1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Efhd1Q9D4J1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhd1Q9D4J1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms