Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2Q9BX26 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYCP2Q9BX26 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms