Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC41A3Q96GZ6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms