Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms