Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP188Q5SRE5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms