Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNT1Q5JUK3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms